Phylogenetische Methoden in der historischen Linguistik

Veranstaltungsart: Pro-/Hauptseminar
Zeit: Dienstag 14.00-16.00
Raum: Forum Scientiarum

Gerhard Jäger

Syllabus

Datum	Thema	Literatur	Hausaufgaben
21.10.	Einführung	Jäger (2012)
28.10.	Historische Linguistik: Lautwandel und lexikalischer Wandel	Campbell (2004), Kapitel 2 Crowley & Bowern (2010), Kapitel 2-4
4.11.	Die komparative Methode	Campbell (2004), Kapitel 5 & 6 Crowley & Bowern (2010), Kapitel 5-7 Campbell (2008)	Campbell (2004), Exercises 2.4, 2.6 und 2.7
11.11.	Die indoeuropäische Sprachfamilie		Campbell (2004), Exercise 5.9
25.11.	Phylogenetische Bäume; Maximum Parsimony	Felsenstein (2004), Kapitel 1-3	Hausaufgabe
2.12.	Die IELex-Datenbank; Maximum Parsimony mit IELex Daten; Konsens-Methoden	Felsenstein (2004), Kapitel 30	Experimentieren mit Paup* und diesen Daten
16.12.	Maximum Likelihood-Inferenz; Sequenz-Alinierung
13.1.	Distanzbasierte Methoden
20.1.	Phylogenetische Analyse mit den ASJP-Daten
27.1.	Die Phylogenetische Komparative Methode
3.2.	Longobardis syntaktische Distanzen; Vergleich der verschiedenen Methoden
10.2.

Leistungsnachweise

Zum Erwerb eines Proseminarscheins müssen die Hausaufgaben vollständig schriftlich bearbeitet und beim Seminarleiter eingereicht werden. Für einen Hauptseminarschein ist (in Absprache mit dem Seminarleiter) ein Referat und eine Hausarbeit nötig.

Literatur:

Wir stützen uns im Kurs hauptsächlich auf

• Campbell, Lyle (2004), Historical Linguistics: An Introduction, MIT Press.
  
• Crowley, Terry & Claire Bowern (2010), An Introduction to Historical Linguistics, Oxford.
  
• Durbin, Richard, Sean R. Eddy, Anders Krogh & Graeme Mitchison (1998), Biological Sequence Analysis. Cambridge.
• Felsenstein, Joseph (2004), Inferring Phylogenies. Sunderland.

Nützliche Hintergrundlektüre ist

• Atkinson, Quentin D. & Russell D. Gray (2005), Curious Parallels and Curious Connections—Phylogenetic Thinking in Biology and Historical Linguistics, Systematic Biology 54(4):513–526.
• Baldauf, Sandra L. (2003), Phylogeny for the faint of heart: a tutorial, in TRENDS in Genetics 19(6): 345-351.
• Bouckaert, Remco, Philippe Lemey, Michael Dunn, Simon J. Greenhill, Alexander V. Alekseyenko, Alexei J. Drummond, Russell D. Gray, Marc A. Suchard & Quentin D. Atkinson (2012), Mapping the Origins and Expansion of the Indo-European Language Family, Science 337(6097), 957-960.
  
• Campbell, Lyle (2008), How to show languages are related: Methods for distant genetic relationship, in Brian D. Joseph and Richard D. Janda, eds., The Handbook of Historical Linguistics, 262-282.
• Campbell, Lyle & William J. Poser (2008): Language Classification: History and Method. Cambridge.
• Gray, Russell D. & Quentin Atkinson (2003): Language-tree divergence times support the Anatolian theory of Indo-European origin, Nature 426, 435-439.
  
• Jäger, Gerhard (2012), Wie die Bioinformatik hilft, Sprachgeschichte zu rekonstruieren, in Alfred Nordheim & Klaus Antoni, eds., Grenzüberschreitungen: Der Mensch im Spannungsfeld von Biologie, Kultur und Technik, Bielefeld, 139-166.
• Kondrak, Grzegorz (2002), Algorithms for Language Reconstruction. Ph.D Thesis, University of Toronto.
  
• Wieling, Martijn (2012), A Quantitative Approach to Social and Geographical Dialect Variation. PhD dissertation, University of Groningen.
  

Ressourcen:

• Das Paup* Software-Paket
  
• Das PHYLIP Software-Paket
• Das MEGA Software-Paket
• Information zu Phylogenie-Paketen für R
• Joseph Felsensteins Kurs zur Phylogenetischen Inferenz
• Informationen zum R-Paket phangorn
• Die Dyen-Kruskal-Kognatenliste im R-lesbaren Format
• Eine verbesserte Version der Dyen-Kruskal-Datenbank
  
• Kruskal-Dyen-Originaldatei
• Das Automated Similarity Judgment Program
• Die ASJP-Daten
• Dendroscope
• SplitsTree